B型肝炎病毒本身有各種不同的抗原，其中以表面抗原（HBsAg）及核心抗原（HBcAg）和人體接觸感染較重要，若是B型肝炎病毒曾進入體內感染，則身體會產生相對應的核心抗體（Anti-HBc）來反映此紀錄，因此Anti-HBc呈陽性。而若感染後身體可以將B型肝炎病毒驅逐出體外，便能產生保護性抗體（Anti-HBs），因此體內已無B型肝炎病毒；HBsAg是陰性，而Anti-HBs呈陽性。反之，若身體在一段時間之內，仍無法將B型肝炎病毒驅逐出體外，身體就仍有B型肝炎病毒在體內，因此HBsAg呈陽性，而由於無法產生保護性抗體，因此Anti-HBs呈陰性。若B型肝炎未曾和人接觸，自然無從有任何反應出現，因此HBsAg、Anti-HBs、Anti-HBc皆為陰性。
在台灣二十歲以上成年人約有80%得過B型肝炎病毒感染，因此Anti-HBc呈陽性，其中60-65%感染後，產生抗體、15-20%不產生抗體，若HBsAg呈陽性持續六個月以上成為帶原者；另有約20%沒有被B型肝炎病毒感染，因此Anti-HBc、HBsAg、Anti-HBs皆為陰性，此類病人建議施打疫苗。
值得注意的是，有些感染B型肝炎病毒而產生抗體的健康人，由於抗體的效價隨著時間而減弱，有時可能測不到，因此Anti-HBs由陽性轉為陰性，此時抽血檢驗便可能得到HBsAg陰性、Anti-HBs陰性、Anti-HBc陽性的結果；另有一些B型肝炎帶原者（HBsAg陽性、Anti-HBs陰性、Anti-HBc陽性），隨著感染病程進行，體內的B型肝炎病毒會產生突變，當突變的基因正好位於表面抗原檢驗偵測區時，則用一般抽血就無法偵測到表面抗原，因此HBsAg原來是陽性就會被測為陰性，此種現象常會被誤為B型肝炎已被「治癒」或「消失了」，其實是表面抗原被偵測區突變隱藏起來而已，B型肝炎病毒仍然在病人體內活的「好好的」，臨床上稱此種表面抗原由陽性轉陰性的情形為『B型肝炎病毒遲發性陰轉』，這樣的病人仍然是帶原者，只是HBsAg陰性、Anti-HBs陰性、Anti-HBc陽性罷了。
一般的健康檢查只檢測HBsAg和 Anti-HBs，若兩者皆為陰性時，常會建議病人施打疫苗，由於低抗體效價的健康者和B型肝炎病毒遲發性陰轉之帶原者所佔比例不高，在大部分情況下，這樣的判斷是符合現實狀況的，但若事先做過病史詢問，知道病人以往感染過B型肝炎或為帶原者，則應在考慮施打疫苗前，先檢驗Anti-HBc來鑑別診斷，若為陰性，則表示以往的病史可能有誤，仍應打疫苗；若為陽性，則可能是先前已感染過的後二者病人，就不用打疫苗了。同樣的，在HBsAg陰性、Anti-HBs陰性下接受疫苗注射，而後檢驗Anti-HBs陰性者，則可補測Anti-HBc。若Anti-HBc陰性，可考慮加打疫苗；若Anti-HBc陽性，則可能為先前所提及的兩種情況之一，這樣的病人就不用再打疫苗了。
至於民國74年後出生，曾接受B型肝炎疫苗注射的年輕人，則面臨出生後B型肝炎疫苗接種完沒有產生抗體（Anti-HBs陰性），或產生的抗體持續性不夠，時間久了抗體效價減弱，甚至抗體消失的問題，因此可以約在15歲以後至醫療院所抽血檢查，若Anti-HBs為陰性，建議再施打疫苗，若Anti-HBs為陽性，則抗體的保護作用仍在，不用擔心，幾年後再追蹤即可。